El CNAG-CRG amplía su capacidad con un supercomputador desarrollado por Atos

El nuevo supercomputador, desarrollado por Bull, marca de productos tecnológicos de Atos, dispone de 4.272 núcleos de computación, 44 TB de memoria y 4,2 Petabytes de capacidad de almacenamiento en disco.  Un genoma completo ocupa desde 100 hasta 300 Gigabytes, si bien tras seleccionar la información relevante su tamaño se reduce a unos 300 Megabytes.

El CNAG-CRG es una organización sin ánimo de lucro financiada con fondos públicos. Desde el 2015 forma parte del Centro de Regulación Genómica (CRG). El centro participa en proyectos de secuenciación a gran escala en áreas tan diversas como la genética del cáncer, las enfermedades raras, las interacciones huésped-patógeno, la conservación de especies amenazadas, los estudios evolutivos y la mejora de especies útiles en agricultura, una tarea donde Atos contribuye desarrollando plataformas de análisis y supercomputación que permiten impulsar los nuevos conocimientos más rápidamente, con aplicaciones de gran alcance.

El CNAG-CRG secuencia más de 60.000 millones de bases genómicas todos los días y necesita realizar un análisis rápido y preciso para procesar grandes volúmenes de datos de la manera más eficiente posible. “Es una labor enorme y compleja –explica Albert Trill responsable de High Performance Computing en el área de Big Data & Security de Atos-, se trata de realizar análisis computacionales para descifrar el conocimiento biológico. Una tarea que gracias a la supercomputación es mucho más rápida y precisa”.

Para atender estas enormes demandas de proceso y de cálculo, Atos desarrolló un cluster de computación hecho a medida, basado en la familia de procesadores Intel® Xeon® E5, que permite realizar análisis de datos de alto rendimiento (HPDA) en secuencias del genoma.

Gracias es este nuevo sistema, el CNAG-CRG tiene previsto ofrecer análisis genómicos más profundos y completos a las organizaciones sanitarias y grupos de investigación. Además, la nueva plataforma mantiene la posición de liderazgo del CNAG-CRG como una de las principales instituciones de investigación genómica del mundo a la vez que le permite alcanzar un mayor rendimiento y reducir costes.